Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a4Q9QZR9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms