Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Copg1Q9QZE5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms