Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc3Q9QZC1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trpc3Q9QZC1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms