Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubxn8Q9QZ49 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms