Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndrg3Q9QYF9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndrg3Q9QYF9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms