Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nufip1Q9QXX8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nufip1Q9QXX8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms