Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx8Q9QXV1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms