Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trp53inp1Q9QXE4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms