Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Homer2Q9QWW1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer2Q9QWW1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms