Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rai2Q9QVY8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rai2Q9QVY8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms