Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfmbt1Q9JMD1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms