Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkap1Q9JMB0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms