Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Reep6Q9JM62 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Reep6Q9JM62 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms