Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rabgef1Q9JM13 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rabgef1Q9JM13 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rabgef1Q9JM13 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rabgef1Q9JM13 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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