Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pias4Q9JM05 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pias4Q9JM05 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pias4Q9JM05 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pias4Q9JM05 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pias4Q9JM05 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pias4Q9JM05 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pias4Q9JM05 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms