Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col5a3Q9JLI2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Col5a3Q9JLI2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col5a3Q9JLI2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms