Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx5Q9JL61 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx5Q9JL61 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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