Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3aQ9JKX8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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