Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ldb3Q9JKS4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ldb3Q9JKS4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms