Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scamp5Q9JKD3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms