Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ybx3Q9JKB3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ybx3Q9JKB3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms