Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uchl3Q9JKB1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uchl3Q9JKB1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms