Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msgn1Q9JK54 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms