Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra4Q9JJT2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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