Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Caln1Q9JJG7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Caln1Q9JJG7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caln1Q9JJG7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms