Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Efcc1Q9JJF6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Efcc1Q9JJF6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Efcc1Q9JJF6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efcc1Q9JJF6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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