Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms