Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rb1cc1Q9ESK9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms