Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp29Q9ES63 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp29Q9ES63 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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