Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube3bQ9ES34 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube3bQ9ES34 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube3bQ9ES34 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube3bQ9ES34 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube3bQ9ES34 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube3bQ9ES34 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube3bQ9ES34 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms