Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn2Q9ER65 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn2Q9ER65 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms