Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn12Q9ER56 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn12Q9ER56 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms