Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ44

Vmn1r41, Vomeronasal type-1 receptor 41, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r41Q9EQ44 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Vmn1r41Q9EQ44 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Vmn1r41Q9EQ44 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Vmn1r41Q9EQ44 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Vmn1r41Q9EQ44 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r41Q9EQ44 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r41Q9EQ44 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Vmn1r41Q9EQ44 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r41Q9EQ44 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Vmn1r41Q9EQ44 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vmn1r41Q9EQ44 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Vmn1r41Q9EQ44 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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