Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms