Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rnft1Q9DCN7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnft1Q9DCN7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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