Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Hmg20aQ9DC33 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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