Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Csnk1dQ9DC28 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Csnk1dQ9DC28 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csnk1dQ9DC28 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Csnk1dQ9DC28 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Csnk1dQ9DC28 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csnk1dQ9DC28 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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