Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms