Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc97Q9DBT3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms