Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms