Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pop5Q9DB28 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pop5Q9DB28 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms