Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift46Q9DB07 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ift46Q9DB07 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ift46Q9DB07 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ift46Q9DB07 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ift46Q9DB07 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ift46Q9DB07 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ift46Q9DB07 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift46Q9DB07 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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