Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc89Q9DA73 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms