Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco2Q9DA21 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco2Q9DA21 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms