Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms