Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d4aQ9D7V1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh2d4aQ9D7V1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh2d4aQ9D7V1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh2d4aQ9D7V1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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