Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbe1Q9D6Y9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms