Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc9bQ9D6E4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9bQ9D6E4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms