Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rab11fip1Q9D620 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11fip1Q9D620 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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