Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc81Q9D5W4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc81Q9D5W4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms